Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XRCC4Q13426 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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