Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGDRQ13258 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGDRQ13258 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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