Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
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