Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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TRAF1Q13077 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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TRAF1Q13077 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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TRAF1Q13077 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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TRAF1Q13077 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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TRAF1Q13077 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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TRAF1Q13077 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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TRAF1Q13077 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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TRAF1Q13077 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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TRAF1Q13077 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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TRAF1Q13077 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF1Q13077 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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