Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms