Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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