Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREBF2Q12772 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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