Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms