Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms