Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms