Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms