Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms