Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK18Q07002 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms