Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FMODQ06828 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FMODQ06828 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FMODQ06828 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FMODQ06828 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms