Protein–RNA interactions for Protein: Q05925

EN1, Homeobox protein engrailed-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EN1Q05925 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EN1Q05925 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EN1Q05925 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EN1Q05925 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EN1Q05925 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EN1Q05925 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EN1Q05925 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EN1Q05925 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EN1Q05925 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EN1Q05925 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EN1Q05925 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EN1Q05925 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EN1Q05925 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EN1Q05925 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EN1Q05925 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EN1Q05925 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EN1Q05925 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EN1Q05925 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EN1Q05925 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EN1Q05925 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EN1Q05925 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EN1Q05925 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EN1Q05925 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EN1Q05925 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EN1Q05925 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms