Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNEQ04844 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms