Protein–RNA interactions for Protein: Q02985

CFHR3, Complement factor H-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR3Q02985 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms