Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK16Q00536 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms