Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms