Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS4XP62701 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS4XP62701 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms