Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO4P61968 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO4P61968 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO4P61968 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO4P61968 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMO4P61968 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO4P61968 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms