Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME5P56597 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME5P56597 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME5P56597 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME5P56597 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME5P56597 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME5P56597 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME5P56597 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME5P56597 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME5P56597 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME5P56597 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NME5P56597 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NME5P56597 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NME5P56597 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME5P56597 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME5P56597 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME5P56597 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms