Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFDNP55196 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFDNP55196 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AFDNP55196 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFDNP55196 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
AFDNP55196 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AFDNP55196 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
AFDNP55196 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AFDNP55196 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFDNP55196 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFDNP55196 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AFDNP55196 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AFDNP55196 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AFDNP55196 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AFDNP55196 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFDNP55196 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFDNP55196 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFDNP55196 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFDNP55196 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFDNP55196 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFDNP55196 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFDNP55196 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFDNP55196 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFDNP55196 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFDNP55196 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFDNP55196 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFDNP55196 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFDNP55196 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFDNP55196 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFDNP55196 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFDNP55196 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFDNP55196 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFDNP55196 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AFDNP55196 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFDNP55196 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFDNP55196 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFDNP55196 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms