Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOSBP53539 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOSBP53539 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOSBP53539 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOSBP53539 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms