Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SMARCA4P51532 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SMARCA4P51532 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA4P51532 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms