Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX1P48742 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX1P48742 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX1P48742 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX1P48742 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX1P48742 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX1P48742 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX1P48742 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX1P48742 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX1P48742 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LHX1P48742 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX1P48742 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX1P48742 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX1P48742 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms