Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRXP46100 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRXP46100 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRXP46100 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRXP46100 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRXP46100 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRXP46100 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms