Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms