Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms