Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP8P40818 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP8P40818 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP8P40818 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP8P40818 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP8P40818 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP8P40818 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP8P40818 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP8P40818 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP8P40818 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP8P40818 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP8P40818 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP8P40818 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms