Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms