Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJC1P36383 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJC1P36383 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJC1P36383 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJC1P36383 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJC1P36383 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJC1P36383 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms