Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms