Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCD1P33897 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms