Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRS3P32247 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms