Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPS1P31327 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPS1P31327 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPS1P31327 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPS1P31327 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPS1P31327 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPS1P31327 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPS1P31327 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPS1P31327 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CPS1P31327 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPS1P31327 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPS1P31327 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CPS1P31327 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CPS1P31327 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
CPS1P31327 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPS1P31327 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPS1P31327 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPS1P31327 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPS1P31327 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPS1P31327 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPS1P31327 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPS1P31327 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CPS1P31327 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPS1P31327 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms