Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms