Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTR2AP28223 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms