Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
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