Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA6P23229 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms