Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD247P20963 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD247P20963 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD247P20963 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD247P20963 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms