Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCP20941 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCP20941 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCP20941 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCP20941 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms