Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms