Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODC1P11926 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ODC1P11926 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ODC1P11926 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ODC1P11926 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ODC1P11926 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ODC1P11926 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ODC1P11926 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODC1P11926 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODC1P11926 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODC1P11926 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms