Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP2C9P11712 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP2C9P11712 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms