Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HKR1P10072 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HKR1P10072 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HKR1P10072 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HKR1P10072 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms