Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms