Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCCAP05165 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCCAP05165 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCCAP05165 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCCAP05165 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCCAP05165 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCCAP05165 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCCAP05165 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCCAP05165 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCAP05165 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCAP05165 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCAP05165 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCAP05165 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCAP05165 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCAP05165 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCAP05165 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCAP05165 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCAP05165 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCAP05165 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCAP05165 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCAP05165 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCAP05165 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCAP05165 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCAP05165 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCAP05165 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCAP05165 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCAP05165 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCAP05165 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCAP05165 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCAP05165 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCAP05165 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCCAP05165 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCCAP05165 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCCAP05165 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PCCAP05165 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCAP05165 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCAP05165 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCAP05165 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCAP05165 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms