Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-7P01780 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms