Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LTAP01374 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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LTAP01374 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LTAP01374 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LTAP01374 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LTAP01374 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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LTAP01374 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LTAP01374 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LTAP01374 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LTAP01374 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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